Al igual que en medicina humana, existen ciertas patologías del aparato reproductor de nuestros pacientes que requieren de una rápida evaluación y actuación. Son ejemplos de ello la piometra (infecciones de matriz); problema frecuente en hembras no esterilizadas de edad avanzada y los abscesos prostáticos en el caso de los machos.
Además, existe la posibilidad de realizar citologías o analíticas específicas del sistema reproductor para determinar, por ejemplo, el momento del ciclo en el que se encuentra una hembra.